MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006461	A	6	6	73	78	100 %	0 %	0 %	0 %	55979970
2	NC_006461	CTC	2	6	79	84	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979970
3	NC_006461	CCT	2	6	99	104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979970
4	NC_006461	ACCT	2	8	145	152	25 %	25 %	0 %	50 %	55979970
5	NC_006461	CCG	2	6	227	232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979970
6	NC_006461	CTT	2	6	273	278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55979970
7	NC_006461	GCCTC	2	10	320	329	0 %	20 %	20 %	60 %	55979970
8	NC_006461	G	7	7	342	348	0 %	0 %	100 %	0 %	55979970
9	NC_006461	CTC	2	6	360	365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979970
10	NC_006461	GGA	2	6	435	440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979970
11	NC_006461	CGC	2	6	513	518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979970
12	NC_006461	GAG	2	6	526	531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979970
13	NC_006461	C	6	6	569	574	0 %	0 %	0 %	100 %	55979970
14	NC_006461	CCTGCC	2	12	624	635	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55979970
15	NC_006461	CCCG	2	8	664	671	0 %	0 %	25 %	75 %	55979970
16	NC_006461	GGCCGA	2	12	714	725	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55979970
17	NC_006461	TGGCCC	2	12	749	760	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55979970
18	NC_006461	ACC	2	6	923	928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55979970
19	NC_006461	CCT	2	6	936	941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979970
20	NC_006461	GGA	2	6	945	950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979970
21	NC_006461	TCC	2	6	959	964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979970
22	NC_006461	CCG	2	6	968	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979970
23	NC_006461	AGG	3	9	995	1003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979970
24	NC_006461	GCCC	2	8	1005	1012	0 %	0 %	25 %	75 %	55979970
25	NC_006461	CCT	2	6	1056	1061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979970
26	NC_006461	CGAGCC	2	12	1115	1126	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55979970
27	NC_006461	G	6	6	1133	1138	0 %	0 %	100 %	0 %	55979970
28	NC_006461	GGT	3	9	1158	1166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979970
29	NC_006461	ACC	2	6	1238	1243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55979971
30	NC_006461	TCG	2	6	1245	1250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55979971
31	NC_006461	GGGCC	2	10	1330	1339	0 %	0 %	60 %	40 %	55979971
32	NC_006461	CGG	2	6	1393	1398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55979971
33	NC_006461	TCG	2	6	1467	1472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55979971
34	NC_006461	GCTGGA	2	12	1513	1524	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55979971
35	NC_006461	CAA	2	6	1534	1539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55979971
36	NC_006461	GCG	2	6	1592	1597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55979971
37	NC_006461	TCA	2	6	1677	1682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55979971
38	NC_006461	G	6	6	1685	1690	0 %	0 %	100 %	0 %	55979971
39	NC_006461	G	6	6	1846	1851	0 %	0 %	100 %	0 %	55979971
40	NC_006461	GAG	2	6	1877	1882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979971
41	NC_006461	CTC	2	6	1898	1903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979971
42	NC_006461	GCGG	2	8	1912	1919	0 %	0 %	75 %	25 %	55979971
43	NC_006461	AGG	2	6	1935	1940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979971
44	NC_006461	CCCTGG	2	12	1944	1955	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55979971
45	NC_006461	CGAG	2	8	1965	1972	25 %	0 %	50 %	25 %	55979971
46	NC_006461	CGGGA	2	10	1979	1988	20 %	0 %	60 %	20 %	55979971
47	NC_006461	ACC	2	6	1992	1997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55979971
48	NC_006461	GGAGGG	2	12	1999	2010	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	55979971
49	NC_006461	TCCTC	2	10	2016	2025	0 %	40 %	0 %	60 %	55979971
50	NC_006461	GGA	2	6	2026	2031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979971
51	NC_006461	TGG	2	6	2034	2039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979971
52	NC_006461	GAC	2	6	2102	2107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55979971
53	NC_006461	GGC	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55979971
54	NC_006461	G	7	7	2140	2146	0 %	0 %	100 %	0 %	55979971
55	NC_006461	GAC	2	6	2165	2170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55979971
56	NC_006461	CGGG	2	8	2198	2205	0 %	0 %	75 %	25 %	55979971
57	NC_006461	G	6	6	2214	2219	0 %	0 %	100 %	0 %	55979971
58	NC_006461	GGA	2	6	2341	2346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979971
59	NC_006461	GAG	3	9	2453	2461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979971
60	NC_006461	GGGCC	2	10	2464	2473	0 %	0 %	60 %	40 %	55979971
61	NC_006461	GCC	2	6	2492	2497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979971
62	NC_006461	GAC	2	6	2541	2546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55979972
63	NC_006461	AGG	2	6	2548	2553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979972
64	NC_006461	GGA	2	6	2660	2665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979972
65	NC_006461	TCC	2	6	2686	2691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979972
66	NC_006461	TCC	2	6	2746	2751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979972
67	NC_006461	CCG	2	6	2776	2781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979972
68	NC_006461	TCC	2	6	2857	2862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979972
69	NC_006461	GAC	2	6	2868	2873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55979972
70	NC_006461	GGAGGT	2	12	2924	2935	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	55979972
71	NC_006461	CAA	3	9	2951	2959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55979972
72	NC_006461	GAC	2	6	3084	3089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55979972
73	NC_006461	CTC	3	9	3090	3098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979972
74	NC_006461	GAG	2	6	3180	3185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979972
75	NC_006461	GGA	2	6	3191	3196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979972
76	NC_006461	TGG	2	6	3211	3216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979972
77	NC_006461	G	6	6	3220	3225	0 %	0 %	100 %	0 %	55979972
78	NC_006461	GGA	2	6	3248	3253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979972
79	NC_006461	TCC	2	6	3280	3285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979972
80	NC_006461	CGC	2	6	3293	3298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979972
81	NC_006461	CGG	2	6	3433	3438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55979972
82	NC_006461	ATG	2	6	3468	3473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55979972
83	NC_006461	TCC	2	6	3529	3534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979972
84	NC_006461	GCCCC	2	10	3535	3544	0 %	0 %	20 %	80 %	55979972
85	NC_006461	CAC	2	6	3551	3556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55979972
86	NC_006461	GGC	2	6	3575	3580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55979972
87	NC_006461	GAC	2	6	3582	3587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55979972
88	NC_006461	GTG	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979972
89	NC_006461	GGC	2	6	3636	3641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55979972
90	NC_006461	GGA	2	6	3649	3654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979972
91	NC_006461	G	6	6	3733	3738	0 %	0 %	100 %	0 %	55979972
92	NC_006461	CGA	2	6	3773	3778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55979972
93	NC_006461	GGT	2	6	3839	3844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979972
94	NC_006461	CGC	2	6	3848	3853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979972
95	NC_006461	GAC	2	6	3878	3883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55979972
96	NC_006461	AGG	2	6	3997	4002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979973
97	NC_006461	GAG	2	6	4050	4055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979973
98	NC_006461	GGGGTA	2	12	4065	4076	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	55979973
99	NC_006461	CCT	2	6	4112	4117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979973
100	NC_006461	GAG	2	6	4131	4136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979973
101	NC_006461	GC	3	6	4155	4160	0 %	0 %	50 %	50 %	55979973
102	NC_006461	GAG	2	6	4215	4220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979973
103	NC_006461	TCC	2	6	4243	4248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979973
104	NC_006461	GGAAG	2	10	4382	4391	40 %	0 %	60 %	0 %	55979973
105	NC_006461	GGT	2	6	4395	4400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979973
106	NC_006461	GGC	2	6	4482	4487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55979973
107	NC_006461	GGA	2	6	4493	4498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979973
108	NC_006461	GGT	2	6	4587	4592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979973
109	NC_006461	AGA	2	6	4607	4612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55979973
110	NC_006461	TCCCC	2	10	4655	4664	0 %	20 %	0 %	80 %	55979973
111	NC_006461	C	6	6	4661	4666	0 %	0 %	0 %	100 %	55979973
112	NC_006461	TCC	2	6	4711	4716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979973
113	NC_006461	GGA	2	6	4742	4747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979973
114	NC_006461	G	7	7	4788	4794	0 %	0 %	100 %	0 %	55979973
115	NC_006461	CCT	2	6	4841	4846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979973
116	NC_006461	GAG	2	6	4872	4877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979973
117	NC_006461	CCT	2	6	4924	4929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979974
118	NC_006461	C	6	6	4943	4948	0 %	0 %	0 %	100 %	55979974
119	NC_006461	TGA	2	6	5026	5031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55979974
120	NC_006461	AGG	2	6	5073	5078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979974
121	NC_006461	ACC	2	6	5130	5135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55979974
122	NC_006461	CTC	2	6	5159	5164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979974
123	NC_006461	CCT	2	6	5179	5184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979974
124	NC_006461	GCGG	2	8	5242	5249	0 %	0 %	75 %	25 %	55979974
125	NC_006461	GGGCCC	2	12	5320	5331	0 %	0 %	50 %	50 %	55979974
126	NC_006461	C	7	7	5329	5335	0 %	0 %	0 %	100 %	55979974
127	NC_006461	GGT	3	9	5347	5355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979974
128	NC_006461	G	6	6	5375	5380	0 %	0 %	100 %	0 %	55979974
129	NC_006461	GGA	2	6	5386	5391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979974
130	NC_006461	GAG	2	6	5396	5401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979974
131	NC_006461	CCA	2	6	5431	5436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55979974
132	NC_006461	C	6	6	5444	5449	0 %	0 %	0 %	100 %	55979974
133	NC_006461	GGC	2	6	5474	5479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55979974
134	NC_006461	CGC	2	6	5526	5531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979975
135	NC_006461	AAG	2	6	5602	5607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55979975
136	NC_006461	TCT	2	6	5693	5698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55979975
137	NC_006461	GGT	2	6	5699	5704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979975
138	NC_006461	GAG	2	6	5715	5720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979975
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267	NC_006461	CCT	2	6	14775	14780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979982
268	NC_006461	CGG	2	6	14790	14795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55979982
269	NC_006461	GGA	2	6	14814	14819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979982
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403	NC_006461	CGG	2	6	19436	19441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55979987
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